协和医学院院长胡顿、司徒雷登、博文（左起）三人在囚所前合影，直到1945年，三人才重获自由
司徒雷登被带回北平后，被关进美国海军陆战队兵营三楼。屋里约有五十名英国人和美国人，一群杂七杂八的人，由一堵开有一扇门的隔墙分隔开。司徒雷登说：“我很快就认出了亨利·胡顿博士、斯纳珀博士和特利弗·博文博士。三位都是协和医学院的，也是我后来长期受监禁时的难友。我出于某种预感，选择了一张靠近他们的床位。”一个月后，司徒雷登与协和医学院胡顿等三人被转移到胡顿家里——一所清朝皇族迷人的住宅。四个月后，三人又被转移到一个英国商人荒凉的后院住宅，在这个破旧的房子里开始了为期三年零八个月的监禁生活。司徒雷登回忆，在这个地狱般的小屋里，“冬天，我们并非总是温暖而舒适的。我们在没有暖气的过道里吃饭，常常是我们还在桌上吃着饭的时候，杯子里的水就结冰了。夏天，狭窄的小院十分炎热。天冷时我们就穿上中国的棉袍子，再罩一些衣服，而天一热就把它们全脱掉。但有一点我们是知道得很清楚的：不会有客人，每天的情况都完全一样”。又说：“即使这样，情况也有变化的时候，其中一次是由‘北京人’引起的。她（我相信这是正确的性别）的举世闻名的骨头原存在协和医学院，仿制出一些惟妙惟肖的复制品之后，只有专家才能分辨其真伪。某些日本科学家显然感到，他们国家在世界上（以及在北平）所处的新地位，使他们有资格享有这一史前时期的宝物。不管怎样，有一天宪兵军官们来向胡顿和博文询问此事了。他们如实地回答说不知道这些骨头在哪里。事实上，为了安全起见，已把这些宝物装进一个宝箱送到秦皇岛去了，一艘美国运输船预定要在珍珠港事件发生的前后去那里接运海军陆战队的一个分遣队。化石是交给了运输舰或是丢在海滩上了，或是遭到了别的命运，我的两位难友当然全然不知。”